La Vicerrectoría de Identidad Universitaria (VRIU) tiene como misión fortalecer la identidad landivariana e impulsar la integración institucional a través de diferentes direcciones, centros y comisiones. La Dirección de Convivencia y Ambientes Seguros se centra en promover la cultura del cuidado, la convivencia pacífica y la implementación de protocolos que garanticen ambientes seguros. Por su parte, la Dirección de Gestión de Identidad Institucional trabaja en consolidar la identidad inspirada en la espiritualidad ignaciana, mediante acciones de formación, investigación y proyección social. Bajo su coordinación se encuentran el Centro Pastoral Universitario Landivariano, que fomenta valores espirituales y voluntariado; el Centro de Pensamiento Ignaciano, que investiga y difunde la espiritualidad ignaciana; el Centro Landivariano de Enlace y Vinculación, que fortalece la relación con egresados y conecta con el mercado laboral; y el Centro de Responsabilidad Social Universitaria, encargado de impulsar proyectos con impacto ético y social.
Por otro lado, la Dirección de Gestión de Integración Universitaria busca generar oportunidades de desarrollo estudiantil a través de programas de becas, liderazgo, deporte y arte. En esta línea, el Centro de Gestión de Becas administra y acompaña a los estudiantes becados; el Centro de Liderazgo Estudiantil fomenta la participación política y ciudadana bajo el liderazgo ignaciano; el Centro Deportivo Landivariano promueve la salud, el trabajo en equipo y la identidad institucional a través del deporte; mientras que el Centro de Artes Landívar impulsa la creatividad y el pensamiento crítico mediante expresiones artísticas y culturales. Además, la VRIU se apoya en la Comisión Estratégica de la Política de Identidad e Integración y en la Comisión para la Consolidación de la Identidad, ambas orientadas a asesorar, evaluar y fortalecer la Agenda de Identidad e Integración dentro del Sistema Universitario Landivariano.